完成毛竹全長(cháng)cDNA文庫構建，精確測定1萬(wàn)余條基因序列，是林業(yè)領(lǐng)域基因組學(xué)研究的一個(gè)重大突破

　　我國科學(xué)家日前完成了包括毛竹葉片、筍和萌發(fā)種子等在內的毛竹全長(cháng)cDNA文庫構建，并精確測定了1萬(wàn)余條基因序列。

　　這是公共數據庫中繼水稻和擬南芥以外，第三大的植物全長(cháng)cDNA數據信息資源，第一次提供了大量竹亞科基因序列信息，填補了禾本科植物比較基因組學(xué)研究的一個(gè)空白，為進(jìn)一步的基因組測序計劃提供了有效的基因注釋依據。

　　毛竹全長(cháng)cDNA文庫構建和基因序列精確測定，是“毛竹基因組測序研究”重大科研項目的第一部分。該項目由財政部、科技部支持，國家林業(yè)局行業(yè)科研專(zhuān)項立項重點(diǎn)支撐，中國林業(yè)科學(xué)研究院林研所、國際竹藤網(wǎng)絡(luò )中心與中國科學(xué)院國家基因研究中心合作承擔。

　　科學(xué)家們在完成毛竹全長(cháng)cDNA文庫構建并精確測定1萬(wàn)余條基因序列的同時(shí)，還首次根據毛竹大規模的基因序列統計了毛竹基因的一些基本信息，包括GC含量、密碼子使用偏好性、簡(jiǎn)單重復序列、小分子RNA和轉座子的統計等。另外，科學(xué)家們根據鑒定到的42組禾本科同源基因，進(jìn)行了系統發(fā)育樹(shù)分析，分析顯示毛竹與水稻具有最近的進(jìn)化關(guān)系。這對禾本科植物的進(jìn)一步研究提供了極其重要的信息，對林業(yè)領(lǐng)域基因組學(xué)研究是一個(gè)重大突破。

　　同時(shí)，作為大規模開(kāi)展毛竹基因組測序的關(guān)鍵性基礎研究工作，科學(xué)家們還順利完成了兩套高質(zhì)量、高覆蓋率的毛竹BAC文庫構建工作，為全面開(kāi)展毛竹基因組測序研究的各項預研工作做好了準備。

　　毛竹是世界上最重要的竹類(lèi)植物之一，也是我國分布范圍最廣、種植面積最大、經(jīng)濟價(jià)值最高的竹種，在禾本科植物中占有特殊的地位。而禾本科類(lèi)植物是人類(lèi)獲取食物和潛在可再生能源的主要來(lái)源。為了進(jìn)行更全面的比較基因組學(xué)的研究，科學(xué)工作者需要不斷積累來(lái)自于不同種類(lèi)的禾本科植物的基因信息和基因組信息。目前，在公共數據庫中，禾本科的大多數亞科（超過(guò)100個(gè)種類(lèi)）都有大量相應的基因組信息或表達信息，只有竹亞科（包含約1000多個(gè)種類(lèi)）僅有少量的序列信息。毛竹全長(cháng)cDNA文庫構建的完成和1萬(wàn)余條基因序列的精確測定填補了這一方面的空缺。