歐洲生物信息學(xué)研究所攜手全球30個(gè)實(shí)驗室

最新生物學(xué)信息圖表標準發(fā)布

　　物理學(xué)家組織網(wǎng)8月11日報道稱(chēng)，歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗室下屬的歐洲生物信息學(xué)研究所（EMBL-EBI），與遍布世界的30個(gè)實(shí)驗室一起聯(lián)合發(fā)布了一套用圖表表示生物學(xué)信息的新標準。如同電子學(xué)中的電路圖一樣，該套標準圖表的應用將會(huì )使生物學(xué)研究領(lǐng)域中復雜信息的交流更加容易，使模型變得準確、高效和容易理解。新標準稱(chēng)為系統生物學(xué)圖釋?zhuān)⊿BGN），發(fā)表在近期出版的《自然?生物技術(shù)》雜志上。

　　標準化的圖表，做為一種視覺(jué)語(yǔ)言，被廣泛應用于多個(gè)學(xué)科領(lǐng)域。使用標準圖表法傳達復雜信息，表意清晰、易于理解。但在圖表信息占據重要地位的生物學(xué)領(lǐng)域，卻一直沒(méi)有統一的標準圖表描述所有的生物化學(xué)反應、路徑和網(wǎng)絡(luò )。

　　2005年，各國的研究人員開(kāi)始努力開(kāi)發(fā)一種專(zhuān)門(mén)用于分子和系統生物學(xué)研究的新圖表標準，即SBGN項目。該項目由日本東京系統生物學(xué)研究所的北野宏明發(fā)起，英國辛克斯頓歐洲生物信息學(xué)研究所的尼古拉斯?勒?諾瓦克和美國加州理工學(xué)院的邁克爾?胡克負責協(xié)調。研究團隊則包括生物化學(xué)家、模型制作人員和計算機科學(xué)家。

　　勒?諾瓦克指出，在基因組學(xué)時(shí)代，特別是高通量技術(shù)出現之后，生物學(xué)數據的規?？偭坑辛舜蠓仍鲩L(cháng)，SBGN會(huì )使研究人員更容易了解彼此的模型，更有效地分享數據。它將使眾多的系統生物學(xué)家從中受益，無(wú)論他們研究的重點(diǎn)是生化進(jìn)程中的哪個(gè)環(huán)節。

　　為了確保新圖表不會(huì )變得過(guò)于龐大、復雜，研究人員定義了三種不同類(lèi)型的圖解，互相補充，描述分子過(guò)程、實(shí)體關(guān)系和生化活動(dòng)中的各個(gè)環(huán)節。報道稱(chēng)，SBGN十分簡(jiǎn)單，有眾多研究團體的廣泛參與，相信這種表示法將會(huì )迅速得到廣泛的應用。