印度板塊和歐亞板塊碰撞后導致的青藏高原隆升是新生代以來(lái)地球上最重大的地質(zhì)歷史事件之一，它深刻地影響了青藏高原及鄰近地區的氣候和環(huán)境，進(jìn)而對該地區生物類(lèi)群的起源與演化產(chǎn)生了極大影響。更新世以來(lái)冰期和間冰期的反復作用，進(jìn)一步影響到該地區物種的分化、遷移和擴散。然而，由于對該地區生物類(lèi)群演變的研究較為薄弱，關(guān)于物種對這些重大地質(zhì)和氣候事件的響應機制迄今尚無(wú)定論，特別是在喜馬拉雅-橫斷山這一生物多樣性熱點(diǎn)區域內。之前的研究表明地質(zhì)事件介導的異域分化是該地區物種形成的主要機制，并推測與地質(zhì)事件相關(guān)的生境和氣候因子的分化可能是該過(guò)程中的重要驅動(dòng)力，然而一直缺乏有力證據。

　　中國科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室劉杰博士，在高連明研究員和李德銖研究員的指導下，選取喜馬拉雅-橫斷山地區特有的第三紀孑遺植物喜馬拉雅紅豆杉（Taxuswallichiana）為研究對象，綜合運用分子譜系地理學(xué)、居群遺傳學(xué)和生態(tài)位模擬等方法，對采集自喜馬拉雅紅豆杉整個(gè)分布區的43個(gè)居群共815個(gè)個(gè)體為研究材料進(jìn)行了分析，結合該物種分布地點(diǎn)的氣候數據和該地區的古環(huán)境資料，深入探討了喜馬拉雅紅豆杉的物種形成和居群演化機制。

　　研究結果表明，喜馬拉雅紅豆杉包含兩個(gè)明顯不同的譜系（EHlineage和HMlineage），它們分化的時(shí)間大約在4.2（2.0-6.5)Ma（百萬(wàn)年前）。這個(gè)時(shí)間正好與青藏高原最近一次快速隆升及其造成的氣候變化相吻合。兩個(gè)譜系的生態(tài)因子相關(guān)分析表明它們存在明顯分化。這意味著(zhù)氣候變化造成的生態(tài)因子差異進(jìn)一步促進(jìn)了兩個(gè)譜系的分化。生態(tài)位模擬分析結果顯示這兩個(gè)譜系在末次冰期最盛時(shí)（LastGlacialMaxium,LGM）的分布區要比末次間冰期和目前分布區小，而分子證據同樣支持這兩個(gè)譜系的居群在末次冰期時(shí)發(fā)生了擴張。

　　喜馬拉雅紅豆杉顯著(zhù)的遺傳分化，長(cháng)期的地理隔離，加之生態(tài)位的明顯分化，意味著(zhù)與該地區地質(zhì)、氣候事件密切相關(guān)，區域生態(tài)因子分化促進(jìn)了物種分化，分化為兩個(gè)不同的物種。而兩個(gè)譜系的居群在第四紀末次冰期發(fā)生了擴張，在間冰期發(fā)生了收縮，這和該地區之前研究結果“冰期收縮-間冰期擴張”的結果相反。以上結果意味著(zhù)喜馬拉雅-橫斷山地區物種演化過(guò)程受到了該地區地質(zhì)和氣候事件的共同影響，物種演化的過(guò)程可能比我們之前想象的復雜。

　　上述結果以Geologicalandecologicalfactorsdrivecrypticspeciationofyewsinabiodiversityhotspot為題發(fā)表在植物學(xué)刊物NewPhytologist上。

　　該研究得到了中國科學(xué)院重點(diǎn)研究項目（KSZD-EW-Z-011）、國家自然科學(xué)基金（30700042,31200182）、科技部基礎工作專(zhuān)項（2012FY110800）和云南省中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才項目（2008PY064）等項目的資助。