青稞基因組圖譜全球首發(fā) 有助于作物適應性機制研究

2017-01-17 11:26:14         來(lái)源:廣州日報     瀏覽次數:

  近日,全球首個(gè)青稞基因組圖譜正式繪制成功,其研究成果在線(xiàn)發(fā)表在國際著(zhù)名期刊PNAS雜志上,該研究對青稞的西藏地方品種LasaGoumang進(jìn)行了全基因組測序及圖譜繪制,有助于高原作物的適應性機制研究。

  研究構建圖譜占青稞基因組的87%

  青稞經(jīng)過(guò)藏族人民長(cháng)達3500~4000年的馴化栽培,已經(jīng)完全適應了極端的高原氣候,成了藏族人民的主食。據悉,西藏地區的青稞種植面積占西藏耕地面積的70%。西藏自治區農牧科學(xué)院、西藏自治區大麥和牦牛培育重點(diǎn)實(shí)驗室、中國科學(xué)院、深圳華大基因研究院及華大科技等在內的眾多研究機構,于2012年正式啟動(dòng)了青稞基因組研究合作項目,以揭示青稞的高原適應性機制,解讀其起源、馴化及栽培選育過(guò)程。

  1月13日公布的全球首個(gè)青稞基因組圖譜,對青稞的西藏地方品種LasaGoumang進(jìn)行了全基因組測序及圖譜繪制,獲得了基因圖譜,共包含36151個(gè)蛋白編碼基因。據估計,青稞基因組大小約為4.5Gb,本次研究所構建的青稞基因組圖譜大小為3.89Gb,共占青稞基因組的87%。

  有助于改良高原類(lèi)植物

  對于人們最感興趣的青稞的高原適應性機制問(wèn)題,此次研究人員也做了專(zhuān)門(mén)研究,并發(fā)現了一系列在青稞品種中發(fā)生了正向選擇的基因家族。如,調節轉錄過(guò)程的基因家族,激活轉錄因子的基因家庭,防御反應相關(guān)的基因家庭等都得到了大量的擴張,這些基因家族的擴張使得青稞在面對高原的惡劣環(huán)境時(shí)具有更大的調節彈性,從而具有更好的適應性。

  華大基因該項目負責人趙山岑表示,作為麥族的重要一員,青稞基因組的發(fā)表,不但幫助人們更好地理解大麥類(lèi)作物的不同馴化途徑,同時(shí)也使得我們能夠結合大麥、小麥及其祖先品種一窺麥族的進(jìn)化歷史,“而青稞在耐寒缺氧等極端環(huán)境的適應性問(wèn)題,更好地為我們進(jìn)行高原類(lèi)作物的改良指明了方向,有助于解決民生中的糧食問(wèn)題。”

  

編輯:guoai

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